Jesper Nissen er uddannet historiker. Han arbejder med kommunikation og presse ved Sundhedsstyrelsen og har tidligere været ansat ved bl.a. Dansk Flygtningehjælp og International Organization for Migration. Jesper Nissen udgav i 2008 sammen med journalist Martin Kaae bogen Vejen til Irak, som gennemgår grundlaget for, hvorfor Danmark gik i krig i Irak. Jesper Nissen har desuden udgivet bogen Den strengeste straf (2001) om dødsstraf i Danmark.